Electric eels galore: microsatellite markers for population studies

Fourteen novel microsatellite loci are described and characterized in two species of electric eels, Electrophorus variiand E. voltaifrom floodplains and rivers of the Amazon rainforest. These loci are polymorphic, highly informative, and have the capacity to detect reliable levels of genetic diversity. Likewise, the high combined probability of paternity exclusion value and low combined probability of genetic identity value obtained demonstrate that the new set of loci displays suitability for paternity studies on electric eels. In addition, the cross-amplification of electric eel species implies that it may also be useful in the study of the closely related E. electricus, and to other Neotropical electric fishes (Gymnotiformes) species as tested herein.(AU)

Catorze novos loci microsatélites são descritos e caracterizados em duas espécies de poraquês, Electrophorus varii e E. voltai de planícies alagadas e rios da floresta amazônica. Esses loci são polimórficos, altamente informativos e têm a capacidade de detectar níveis confiáveis de diversidade genética. Da mesma forma, o alto valor de exclusão de paternidade combinado com a baixa probabilidade de identidade genética demonstra que o novo conjunto de loci exibe adequação para estudos de paternidade em poraquês. Além disso, a amplificação cruzada de espécies de peixes elétricos implica que também pode ser útil no estudo da espécie intimamente relacionada E. electricus, e de outras espécies de peixes elétricos neotropicais (Gymnotiformes).(AU)

Genetic diversity and population structure of Brycon nattereri (Characiformes: Bryconidae): a Neotropical fish under threat of extinction

Brycon nattereri is an endangered Neotropical fish reported along conserved stretches of the upper Paraná, Tocantins and São Francisco rivers. Populations of this species have been very rare in some Paraná River sub basins. This study analyzes the genetic diversity and population structure of B. nattereri in a restricted area of occurrence recently identified in upper Paraná River basin. Seven microsatellite loci and 497 bp of D-Loop mitochondrial region were examined in 92 individuals from four points along the area of occurrence. Both molecular markers indicated a single population distributed along a stretch of the river approximately 80 km long. Although some of the data suggest an ancient bottleneck, current levels of genetic diversity (H E = 0.574 and h = 0.616) were similar to those of other species of the genus Brycon. The results suggest that the population of B. nattereri has been able to maintain satisfactory levels of genetic diversity, in spite of the small area of occurrence. These data have highlighted an important conservation area and action may prove essential to improve the quality of the environment, and especially the water and riparian plant life, if the area is to be managed and conserved efficiently.(AU)

Brycon nattereri é um peixe Neotropical ameaçado de extinção reportado para trechos conservados dos rios Paraná, Tocantins e São Francisco. Populações desta espécie têm sido muito raras em algumas sub-bacias do rio Paraná. Este estudo analisou a diversidade genética e a estrutura populacional de B. nattereri em uma área de ocorrência restrita recentemente identificada na bacia do alto rio Paraná. Sete locos microssatélites e 497 pb da região mitocondrial D-Loop foram examinados para 92 indivíduos de quatro pontos ao longo da área de ocorrência. Ambos os marcadores moleculares indicaram uma única população distribuída em um trecho de aproximadamente 80 km do rio. Embora alguns dados tenham sugerido um antigo gargalo genético, os atuais níveis de diversidade genética (H E = 0,574, h = 0,616) foram similares aos de outras espécies do gênero Brycon. Estes resultados sugerem que a população de B. nattereri tem mantido níveis satisfatórios de diversidade genética, apesar da pequena área de ocorrência. Estes dados destacaram uma importante área de conservação e ações podem melhorar a qualidade do ambiente, especialmente para a vida aquática e mata ciliar, se a área for eficientemente manejada e conservada.(AU)

Development and characterization of fifteen polymorphic microsatellite loci in Bryconamericus aff. iheringii (Teleostei: Characidae) and cross-amplification in related Characidae species

Data on 15 novel microsatellite loci from the Neotropical fish Bryconamericus aff. iheringii are presented here. Analyses of 32 individuals from four different streams revealed 192 different alleles, ranging from four to 32 alleles per locus (mean of 12.8 per locus). Observed and expected heterozygosities ranged from 0.094 to 0.813 and 0.205 to 0.952, respectively. These loci showed high polymorphic information content and will be a resource for genetic studies of B. aff. iheringii. Furthermore, several loci also amplified other small Neotropical Characidae (Piabarchus stramineus and Piabina argentea) and should be useful for these species.(AU)

Um total de quinze novos locos microssatélites é aqui apresentado para o pequeno peixe Neotropical Bryconamericus aff. iheringii. A análise de 32 indivíduos provenientes de quatro ribeirões diferentes revelou 192 alelos diferentes, variando de quatro a 32 alelos por loco (média de 12,8 por loco), e heterozigozidades observada e esperada variando de 0,094 a 0,813 e 0,205 a 0,952, respectivamente. O conjunto de locos obtido mostrou alto conteúdo de informação polimórfica e bom potencial para estudos genéticos de B. aff. iheringii, além disso vários locos amplificaram para outras espécies de pequenos Characidae neotropicais (Piabarchus stramineus and Piabina argentea).(AU)

Genetic diversity of Hypostomus ancistroides (Teleostei, Loricariidae) from an urban stream

In this study, random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were applied to analyze the genetic diversity of samples of the Neotropical catfish Hypostomus ancistroides, collected from four sites (S1, S2, S3 and S4) along an urban stream in Southern Brazil. The 11 primers used in RAPD analysis amplified 147 loci, 76 (51.7 percent) of which were polymorphic. The proportions of polymorphic loci observed in the four samples were: 29.93 percent (S1), 31.97 percent (S2), 23.81 percent (S3) and 38.77 percent (S4). The average heterozygosity within sampling localities ranged from 0.1230 to 0.1526 and unbiased genetic distances ranged from 0.0253 to 0.0445. AMOVA partitioned 90.85 percent of the total variation within samples and 9.15 percent among samples. Excepting for the sample pair S1-S2 (phiST = 0.02784; p > 0.05), all others pairwise phiST values were significantly greater than zero, indicating moderate genetic differentiation among catfish samples from four localities. The relative low levels of genetic variation detected in all groups studied could be related to different factors, including the sedentary habit of these fish, which can be eroding the genetic variation of H. ancistroides from each locality.